呆萌的企鹅总是让人发笑，但是不同地方的企鹅却有着完全不同的生活习性，BBC的团队整整准备了50太摄像机，伪装成各种不同的物品，目的就是想接近这群天然呆的生物，拍摄它们一天的生活，看看他们到底是如何在残酷的自然界中得以生存的，原来他们真的不只是会卖萌……
《企鹅卧底日记》制作团队将50台摄像机放在假企鹅和假石头里，混进企鹅群近距离拍摄这些呆萌的企鹅们，为观众展现其不为人知的一面。全片主要分别介绍了三种生活在地球上不同纬度的企鹅。生活在热带秘鲁的洪堡企鹅，生活在亚南极海岛上的跳岩企鹅，以及生活在寒带南极的帝企鹅。企鹅绝对是动物界里最负责任的父母，当它们要生养下一代的时候。企鹅爸爸妈妈会回到世代产蛋的地方，在回归和哺养小企鹅的路程上，企鹅爸爸妈妈们会遇见各种恶劣的环境和凶猛的天敌动物。而小企鹅在破壳出生后，会面对饥饿、天敌和恶劣的自然环境，慢慢成长后，最终也会如同它们爸爸妈妈一样回归到大海。
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